Urodziła się w 1942 roku w Warszawie. Była absolwentką Państwowej Wyższej Szkoły Teatralnej w Warszawie. Debiutowała na scenie w połowie lat 60., a w kolejnych dekadach występowała m.in. w Teatrze im. Juliusza Osterwy w Lublinie oraz w warszawskich teatrach: Powszechnym, Narodowym i Na Woli.
Publiczność telewizyjna znała ją z licznych ról epizodycznych w serialach i filmach, w których pojawiała się przez wiele lat swojej kariery. W ostatnim czasie przypomniała o sobie młodszym widzom rolą Krystyny w serialu „Gang Zielonej Rękawiczki”, gdzie stworzyła postać pełną charakteru, humoru i ciepła.
Gaertner należała do grona aktorek, które przez dekady konsekwentnie budowały swoją obecność zarówno na scenie teatralnej, jak i w produkcjach telewizyjnych. Ceniona była za profesjonalizm, wrażliwość i aktorską uważność, dzięki którym nawet niewielkie role potrafiła wypełnić wyrazistą osobowością.
Istotną częścią dorobku artystycznego była także jej praca w dubbingu, której poświęciła wiele lat. Elżbieta Gaertner użyczała głosu postaciom w filmach aktorskich i animowanych, współtworząc polskie wersje językowe wielu popularnych produkcji. Widzowie mogli usłyszeć ją m.in. w filmach „Dawno temu w trawie”, „Stuart Malutki”, „Richie milioner”, a także w „Harry Potter i Komnata Tajemnic”, gdzie podkładała głos pod postać pielęgniarki Poppy Pomfrey. Jej charakterystyczny, wyrazisty głos często powierzano postaciom o silnej osobowości – barwnym, ekscentrycznym lub nieco mrocznym – dzięki czemu pozostawała jedną z rozpoznawalnych aktorek polskiego dubbingu.
Środowisko teatralne i filmowe żegna artystkę z ogromnym smutkiem.